Pocket Monsters: Mewtwo! Ware wa Koko ni Ari

Le chef de l'équipe Rocket, Giovanni, a trouvé Mewtwo dans une région éloignée de la région de Johto. Alors que Giovanni tente de capturer Mewtwo, Ash et ses amis sont kidnappés par Domino, un nouveau membre de l'équipe Rocket, tout en essayant de sauver Pikachu de Jessie et James. Les Clone Pokemon sont également capturés et sont ensuite utilisés comme appât pour Mewtwo. La situation devient alors une bataille entre les volontés de Mewtwo et Giovanni ; et Mewtwo essaie aussi de découvrir si elle et les clones ont un but dans la vie, même s'ils sont des produits de la science.